| すきま風 | 阿刀田高 | 小説新潮 | 1999年(平11)1月号 |
| 宙ぶらん | 伊集院静 | 小説すばる | 1999年(平11)1月号 |
| 秘密の海 | 難波利三 | 問題小説 | 1999年(平11)1月号 |
| 琴のそら音 | 皆川博子 | 小説新潮 | 1999年(平11)1月号 |
| 姫椿 | 浅田次郎 | オール読物 | 1999年(平11)2月号 |
| 桃―お葉の匂い | 久世光彦 | 小説新潮 | 1999年(平11)2月号 |
| 花椿 | 車谷長吉 | オール読物 | 1999年(平11)2月号 |
| 世の中 | 重松清 | 小説現代 | 1999年(平11)2月号 |
| 夢の回廊 | 梁石日 | 小説新潮 | 1999年(平11)2月号 |
| また夢をゆく | 山本文緒 | 小説すばる | 1999年(平11)3月号 |
| 救われるために | 内田春菊 | 別冊文藝春秋 | 1999年(平11)春号 |
| リリーフ | 西木正明 | オール読物 | 1999年(平11)4月号 |
| エルティブーラの黙示録 | 橋元淳一郎 | ＳＦマガジン | 1999年(平11)5月号 |
| ドライバー | 黒岩重吾 | 小説すばる | 1999年(平11)6月号 |
| たんぽぽ | 小池真理子 | 小説すばる | 1999年(平11)6月号 |
| 捨小舟 | 赤江瀑 | 問題小説 | 1999年(平11)7月号 |
| 薄暮の酒 | 常盤新平 | 問題小説 | 1999年(平11)8月号 |
| 恋自縛 | 野坂昭如 | オール読物 | 1999年(平11)8月号 |
| 鬼になる | 藤田雅矢 | ＳＦマガジン | 1999年(平11)8月号 |
| 麺要斎言行録 | 長部日出雄 | 小説新潮 | 1999年(平11)10月号 |
| 帰宅 | 志水辰夫 | 小説新潮 | 1999年(平11)10月号 |
| 妻の故郷 | 内海隆一郎 | 小説宝石 | 1999年(平11)12月号 |
| 他小説 | 清水義範 | 週刊小説 | 1999年(平11)12月10日・24日号 |
| あとがき 二十世紀最後の小説 | 出久根達郎 | ||
「短篇ベストコレクション 現代の小説2001」 日本文藝家協会 徳間書店 2001年5月15日初刊
選考：内海隆一郎・大河内昭爾・清原康正・出久根達郎・長谷部史親・堀晃
| 算数の呪い | 清水義範 | 小説現代 | 2000年(平12)1月号 |
| 検温 | 山田詠美 | オール読物 | 2000年(平12)1月号 |
| むらさき | 田中小実昌 | 週刊小説 | 2000年(平12)2月25日号 |
| 叔父さん | 永倉萬治 | 小説新潮 | 2000年(平12)4月号 |
| ベル・エポック | なかにし礼 | 別冊文藝春秋 | 2000年(平12)夏号 |
| 虚に棲むひと | 筒井康隆 | オール読物 | 2000年(平12)6月号 |
| eの悲劇 | 幸田真音 | 問題小説 | 2000年(平12)7月号 |
| おめこ電球 | 岩井志麻子 | 小説新潮 | 2000年(平12)8月号 |
| 訪問者 | 薄井ゆうじ | 小説すばる | 2000年(平12)9月号 |
| トリップ | 角田光代 | 小説宝石 | 2000年(平12)9月号 |
| 五人姉妹 | 菅浩江 | ＳＦマガジン | 2000年(平12)9月号 |
| 海馬 | 高山文彦 | 問題小説 | 2000年(平12)9月号 |
| オリンポスの聖女 | 浅田次郎 | オール読物 | 2000年(平12)11月号 |
| 幻灯花 | 黒岩重吾 | 小説すばる | 2000年(平12)11月号 |
| 小さな骨壺 | 会田晃司 | 小説現代 | 2000年(平12)12月号 |
| 座敷童子の夏 | 熊谷達也 | 週刊小説 | 2000年(平12)12月8日号 |
| 大山 | 鈴木光司 | 小説宝石 | 2000年(平12)12月号 |
| 饂飩命 | 出久根達郎 | 小説新潮 | 2000年(平12)12月号 |
| あとがき | 内海隆一郎 |
「短篇ベストコレクション 現代の小説2002」 日本文藝家協会 徳間書店 2002年5月15日初刊
選考：内海隆一郎・清原康正・長谷部史親・堀晃
| オデュッセイア | 恩田陸 | 小説新潮 | 2001年(平13)1月号 |
| 兎を飼う部屋 | 岩井志麻子 | 別冊文藝春秋 | 2001年(平13)冬号 |
| 電脳奥様 | 内田春菊 | オール読物 | 2001年(平13)2月号 |
| リトル・マーメイド | 篠田節子 | 週刊小説 | 2001年(平13)2月9日号 |
| 隠れ里 | 高橋克彦 | 週刊小説 | 2001年(平13)2月23日号 |
| 握る手 | 渡辺淳一 | 小説現代 | 2001年(平13)2月号 |
| 芸者染香 | 加堂秀三 | 小説新潮 | 2001年(平13)4月号 |
| 闇鍋 | 森青花 | 小説NON | 2001年(平13)4月号 |
| 指定席 | 鳴海章 | 問題小説 | 2001年(平13)5月号 |
| 父の恋人 | 内海隆一郎 | 週刊小説 | 2001年(平13)6月22日号 |
| 一実ちゃんのこと | 川上弘美 | 小説推理 | 2001年(平13)6月号 |
| 天狗の落し文 | 筒井康隆 | 小説新潮 | 2001年(平13)6月号 |
| シャンプー | 山田詠美 | オール読物 | 2001年(平13)6月号 |
| 瘋癲老人養護ホーム日記 | 嵐山光三郎 | 小説宝石 | 2001年(平13)7月号 |
| 一角獣 | 小池真理子 | 小説新潮 | 2001年(平13)7月号 |
| 岬 | 志水辰夫 | オール読物 | 2001年(平13)7月号 |
| 情夜 | 浅田次郎 | 小説宝石 | 2001年(平13)9月号 |
| 常世の人 | 高山文彦 | 問題小説 | 2001年(平13)12月号 |
| イザベル | 藤田宜永 | 小説新潮 | 2001年(平13)12月号 |
| 最後のSETISSION | 山之口洋 | ＳＦマガジン | 2001年(平13)12月号 |
| あとがき−ネット時代の短篇小説 | 堀晃 |
「短篇ベストコレクション 現代の小説2003」 日本文藝家協会 徳間書店 2003年6月15日初刊
選考：内海隆一郎・清原康正・長谷部史親・堀晃
| 海の中道 | 阿刀田高 | 小説新潮 | 2002年(平14)1月号 |
| 満ち足りた廃墟 | 岩井志麻子 | オール読物 | 2002年(平14)1月号 |
| 闇が蠢いた日 | 黒岩重吾 | 小説現代 | 2002年(平14)1月号 |
| 各駅停車 | 常磐新平 | 問題小説 | 2002年(平14)1月号 |
| 熊穴いぶし | 西木正明 | 問題小説 | 2002年(平14)1月号 |
| ゲルマ | 重松清 | 小説新潮 | 2002年(平14)2月号 |
| ハラビィ | 東郷隆 | 小説現代 | 2002年(平14)2月号 |
| 火の川 法昌寺百話 | 立松和平 | 問題小説 | 2002年(平14)2月号 |
| 空色の自転車 | 石田衣良 | 小説新潮 | 2002年(平14)3月号 |
| 接吻 | 赤瀬川隼 | 小説宝石 | 2002年(平14)3月号 |
| 言葉のない海 | 菅裕江 | 小説宝石 | 2002年(平14)3月号 |
| 借りた明日 | 佐々木譲 | 小説すばる | 2002年(平14)4月号 |
| 声にしてごらん | 高橋克彦 | ジェイ・ノベル | 2002年(平14)4月号 |
| 電獄仏法本線毒急行じぐり326号の殺人 | 牧野修 | SFマガジン | 2002年(平14)6月号 |
| 夜汽車 | 安東能明 | 小説新潮 | 2002年(平14)7月号 |
| 前進、もしくは前進のように思われるもの | 江國香織 | 小説新潮 | 2002年(平14)7月号 |
| 百日紅 | 帚木蓬生 | 小説新潮 | 2002年(平14)7月号 |
| 余部さん | 筒井康隆 | 小説新潮 | 2002年(平14)9月号 |
| 秋のひまわり | 角田光代 | 小説宝石 | 2002年(平14)9月号 |
| 日曜日の新郎たち | 吉田修一 | 小説現代 | 2002年(平14)12月号 |
| あとがき | 清原康正 |
「短篇ベストコレクション 現代の小説2004」 日本文藝家協会 徳間書店 2004年6月15日初刊
選考：清原康正・長谷部史親・堀晃・村松友視
| 切符 | 浅田次郎 | 小説新潮 | 2003年(平15)1月号 |
| えへんの守 | 泡坂妻夫 | 問題小説 | 2003年(平15)1月号 |
| 光の王 | 森岡浩之 | SF Japan | 2003年(平15)冬季号 |
| 声を探しに | 石田衣良 | 小説すばる | 2003年(平15)2月号 |
| 玉手箱 | 出久根達郎 | オール読物 | 2003年(平15)2月号 |
| 迷子 | 永嶋恵美 | 小説すばる | 2003年(平15)2月号 |
| 桜舞 | 唯川恵 | オール読物 | 2003年(平15)2月号 |
| やわらかなボール | 伊集院静 | 小説現代 | 2003年(平15)3月号 |
| 誰よりも妻を− | 野坂昭如 | オール読物 | 2003年(平15)5月号 |
| そこなう | 江國香織 | 小説新潮 | 2003年(平15)7月号 |
| サイガイホテル | 角田光代 | 小説宝石 | 2003年(平15)7月号 |
| 眺めのいい場所 | 瀬尾まいこ | 小説宝石 | 2003年(平15)7月号 |
| 嫌な女を語る素敵な言葉 | 岩井志麻子 | 小説NON | 2003年(平15)9月号 |
| 作り話 | 東直己 | 小説すばる | 2003年(平15)10月号 |
| キルトの模様 | 内海隆一郎 | 小説宝石 | 2003年(平15)10月号 |
| 磯笛の島 | 熊谷達也 | 小説新潮 | 2003年(平15)10月号 |
| 空中喫煙者 | 筒井康隆 | 小説新潮 | 2003年(平15)10月号 |
| 三センチ四方の絆 | 池永陽 | 小説新潮 | 2003年(平15)11月号 |
| セキュリティ・プロフェッショナル | 草上仁 | SFマガジン | 2003年(平15)11月号 |
| えいっ | 川上弘美 | 野性時代 | 2003年(平15)12月号 |
| あとがき | 長谷部史親 |
「短篇ベストコレクション 現代の小説2005」 日本文藝家協会 徳間書店 2005年6月15日初刊
選考：大河内昭爾・清原康正・長谷部史親・堀晃
| 雨のあと | 阿刀田高 | オール読物 | 2004年(平16)1月号 |
| チヨ子 | 宮部みゆき | 小説すばる | 2004年(平16)1月号 |
| スターティング・オーバー | 石田衣良 | 小説すばる | 2004年(平16)2月号 |
| タイフーン・メーカー | 平安寿子 | 問題小説 | 2004年(平16)2月号 |
| 自転車を漕ぐとき | 薄井ゆうじ | 小説宝石 | 2004年(平16)3月号 |
| いっぺんさん | 朱川湊人 | 月刊ジェイ・ノベル | 2004年(平16)3月号 |
| 鉄の手 | 三羽省吾 | 小説宝石 | 2004年(平16)3月号 |
| バタフライ和文タイプ事務所 | 小川洋子 | 小説現代 | 2004年(平16)4月号 |
| 子猫 | 高樹のぶ子 | オール読物 | 2004年(平16)5月号 |
| 降り暮らす | 唯川恵 | 小説現代 | 2004年(平16)5月号 |
| マジック・アワー | 関口尚 | 小説すばる | 2004年(平16)6月号 |
| 逃げ道 | 筒井康隆 | 小説新潮 | 2004年(平16)6月号 |
| バッド・チューニング | 中島らも | 青春と読書 | 2004年(平16)6月号 |
| 名も知らぬ女 | 村松友視 | 野性時代 | 2004年(平16)6月号 |
| ベル・エポック | 絲山秋子 | 野性時代 | 2004年(平16)7月号 |
| かもめ亭 | 内海隆一郎 | 小説宝石 | 2004年(平16)8月号 |
| 精神感応術 | 泡坂妻夫 | 問題小説 | 2004年(平16)9月号 |
| グレープフルーツ・モンスター | 奥田英朗 | 小説すばる | 2004年(平16)9月号 |
| オヨネン婆の島 | 熊谷達也 | 小説新潮 | 2004年(平16)9月号 |
| 幻夢の邂逅 | かんべむさし | 小松左京マガジン | 2004年(平16)10月号 |
| 冬の旅 | 浅田次郎 | 小説宝石 | 2004年(平16)11月号 |
| ワーク・シェアリング | 草上仁 | SFマガジン | 2005年(平17)12月号 |
| あとがき | 堀晃 |